400
évvel a jövőben járunk, amikor is egy gyilkos
vírus elpusztította a Föld lakosságának 99%-át. Csupán egy fallal
körülzárt, védett városállam, Bregna élte túl az emberiségre sújtó
armageddont. Bregna-ban látszólag tökéletes az élet, az emberek
harmóniában élnek egymással, egy tudósokból álló kongresszus irányítása
alatt. A valóság azonban egészen más képet mutat: a városállam életét
általános riadalom és belső villongások jellemzik. Aeon Flux, a
'Monican' nevű földalatti titkos mozgalom vezető ügynöke, amelyet a The
Handler irányít. Amikor Aeon azt a feladatot kapja, hogy a készülő
forradalom érdekében ölje meg az egyik kormányzati vezetőt, egy
titokzatos világba nyer bepillantást.