Sean Baker akaratán kívül egy Guyver nevű földönkívüli biopáncél
gazdája lesz, amely különleges tulajdonságokat kölcsönöz neki. Az idegen
fegyver segítségségével Sean megkezdi harcát a hüllőszerű lények ellen
melyeket Zoanoidoknak hívnak. A Harc tovább folytatódik, mikor egy
régészeti ásatás közben rábukkan egy ősi idegen űrhajóra, ami eredetileg
a Zoanoidokat a földre szálította. A kormányzati ügynökök és a Chronos
vállalat mutánsai folytatják együttműködésüket a Zoanoidok biomechanikus
technológiájáért. Mindkét fél abban reménykedik, hogy fontos
földönkívüli tárgyakat találnak az ásatáson, és esetleg fényt
deríthetnek a Guyver erejének forrására is.